बॉम्बे हाईकोर्ट ने एनआईए और 7 बरी हुए आरोपियों पर नोटिस जारी किया

29 सितंबर 2008 को, महाराष्ट्र के नाशिक जिले में मुंबई से लगभग 200 किमी दूर स्थित मालेगांव शहर में एक मस्जिद के पास एक मोटरसाइकिल पर लगे एक विस्फोटक उपकरण से विस्फोट हुआ, जिसमें छह लोग मारे गए और 101 अन्य घायल हुए। अपील में कहा गया कि क्रिमिनल ट्रायल में ट्रायल कोर्ट के जज को एक “पोस्टमैन या म्यूट स्पेक्टेटर” की भूमिका निभानी चाहिए। जब प्रोसिक्यूशन को तथ्यों को उजागर करने में असफलता हुई, तो ट्रायल कोर्ट को प्रश्न पूछने और/या गवाहों को बुलाने का अधिकार है, जिसे यह कहा गया है। “ट्रायल कोर्ट ने दुर्भाग्य से एक मात्र डाकघर की भूमिका निभाई और अभियुक्तों को लाभ पहुंचाने के लिए एक कमजोर प्रोसिक्यूशन को अनुमति दी।” अपील ने कहा। इसने नेशनल इन्वेस्टिगेशन एजेंसी (एनआईए) द्वारा मामले की जांच और ट्रायल के तरीके पर भी चिंता जताई और अभियुक्तों को दोषी ठहराने का अनुरोध किया। राज्य एंटी टेररिज्म स्क्वाड (एटीएस) ने सात लोगों को गिरफ्तार करके एक बड़े साजिश का खुलासा किया, और तब से अल्पसंख्यक समुदाय के निवासी क्षेत्रों में कोई धमाका नहीं हुआ, अपील ने कहा। यह दावा किया गया कि एनआईए ने मामले को अपने हाथ में लेने के बाद अभियुक्तों के खिलाफ आरोपों को कमजोर किया। विशेष कोर्ट ने अपने निर्णय में कहा था कि सिर्फ संदेह ही वास्तविक प्रमाण की जगह नहीं ले सकता है और अभियुक्तों के खिलाफ कोई विश्वसनीय या संगठित प्रमाण नहीं था जो दोषी ठहराने के लिए पर्याप्त हो। विशेष जज एके लाहोती ने कहा था कि अभियुक्तों के खिलाफ कोई विश्वसनीय और संगठित प्रमाण नहीं था जो मामले को पर्याप्त संदेह के बिना साबित करे। प्रोसिक्यूशन का दावा था कि धमाका द्वारा दाहिने विंग विचारधारा वाले कट्टरपंथियों ने मुस्लिम समुदाय को धमकाने के इरादे से किया था। एनआईए कोर्ट ने अपने निर्णय में प्रोसिक्यूशन के मामले और जांच के तरीके में कई खामोशियों को उजागर किया और कहा कि अभियुक्तों को संदेह का लाभ मिलना चाहिए। इस मामले में अभियुक्तों में शामिल थे थाकुर और पुरोहित के अलावा रिटायर्ड मेजर रमेश उपाध्याय, अजय रहिरकर, सुधाकर द्विवेदी, सुधाकर चतुर्वेदी और सामीर कुलकर्णी।