19 अक्टूबर को ही था जब जम्मू-कश्मीर पुलिस ने मुफ्ती इरफान अहमद वागय को गिरफ्तार किया, इसके बाद भारत विरोधी आतंकवादी गतिविधियों की साजिश पुलिस विभागों के सामने आई। जम्मू-कश्मीर पुलिस ने पहले ही इन आरोपियों को गिरफ्तार कर लिया था, जिससे समय के साथ सभी आरोपियों को पकड़ने और किसी भी दुर्घटना को रोकने का प्रयास किया गया। एनआईए ने पहले दो अन्य आरोपियों को गिरफ्तार किया था – अमीर रशीद अली के नाम पर जिस कार का उपयोग ब्लास्ट में किया गया था, और जसीर बिलाल वानी ने, जिन्होंने आतंकवादी हमले में शामिल आतंकवादी को तकनीकी सहायता प्रदान की थी। उनकी पूछताछ अभी भी जारी है, जो एनआईए के प्रयासों का हिस्सा है कि वह इस मामले में पूरी आतंकवादी साजिश को समझ सके।
इस मामले की जांच के लिए केंद्रीय गृह मंत्रालय ने एनआईए को जांच का जिम्मा सौंपा था, और आतंकवाद विरोधी एजेंसी ने विभिन्न राज्य पुलिस बलों के साथ मिलकर आतंकवादी मॉड्यूल के हर सदस्य को ट्रैक और गिरफ्तार करने के लिए काम कर रही है।
